自動核酸提取儀是應用配套的核酸提取試劑來自動完成樣本核酸的提取工作的儀器,核酸提取儀分為兩類:一類是大型的自動化的,一般稱為自動液體工作站;另一類是小型自動核酸提取儀,利用封裝好的配套試劑自動完成提取純化過程。
它是以納米生物磁珠為載體的一種新型核酸提取技術,核酸分子可與磁珠表面的硅羥基發(fā)生特異性識別與結合,在外部磁場的作用下發(fā)生聚集或分散,擺脫傳統(tǒng)核酸提取過程中離心、抽取上清液等手工操作流程,從而實現(xiàn)核酸的自動化提取。廣泛應用于臨床疾病診斷、輸血安全、法醫(yī)學鑒定、環(huán)境微生物檢測、食品安全檢測、分子生物學研究等多種領域。
磁珠法核酸提取一般包括裂解、結合、洗滌、洗脫四個主要步驟,每一步驟又可由多種不同的方法單獨或聯(lián)合實現(xiàn),其中裂解環(huán)節(jié)是決定提取之質(zhì)量的重中之重,經(jīng)常也會有老師問到應該如何對裂解液進行優(yōu)化。那么,我們就來分析一下配置裂解液經(jīng)常用的試劑及其作用原理。
1、鹽酸胍、尿素
鹽酸胍在濃度為4-8mol時可斷裂氫鍵,有兩種可能機制:1、變性蛋白和鹽酸胍、尿素優(yōu)先結合,形成變性蛋白-變性劑復合物,當復合物被除去,引起N-D反應平衡向右移動,隨著變性劑濃度增加,天然狀態(tài)的蛋白不斷轉變?yōu)閺秃衔?,導致蛋白質(zhì)*變性;2、鹽酸胍、尿素對氨基酸具有增溶作用,能形成氫鍵,當濃度高時,能破壞水的氫鍵結構,成為非極性殘基的較好溶劑,使蛋白質(zhì)內(nèi)部的疏水殘基伸展和溶解性加強,鹽酸胍、尿素引起的蛋白變性往往是不可逆的。
2、異硫氰酸胍
蛋白質(zhì)變性劑,能迅速溶解蛋白質(zhì),導致細胞結構破碎,核蛋白由于其二級結構的破壞消失而迅速與核酸分離。在通常使用的蛋白質(zhì)變性劑中作用強的是異硫氰酸胍,它們可以使多數(shù)蛋白質(zhì)轉換成一種隨機的卷曲狀態(tài)。含有強的陰離子和陽離子基團,它們可以形成較強的氫鍵。在還原劑存在的情況下,異硫氰酸胍可以斷裂氫鍵,而去垢劑,如SDS存在的情況下,可以破壞疏水作用。